Statssekreterare Erik Thedéen säger till SVT att ett misstag har begåtts, men att man ändå beslutat sig för att låta Sundling behålla pengarna.
I våras avslöjades det att Jan Sundling fick en halvtidslön på 500 000 kronor om året för ett uppdrag på näringsdepartementet, samtidigt som han kammade hem ytterligare 600 000 för statliga styrelseuppdrag i bland annat SJ. Det är inte tillåtet enligt statens regler att vara anställd på regeringskansliet och dessutom få inkomst från andra statliga uppdrag.
Jan Sundling sade till DN i april, strax efter avslöjandet om de dubbla ersättningarna, att han handlat i god tro och inte haft minsta tanke på att hans ersättningar skulle bryta mot statens regelverk.
– Jag tog uppdraget efter en förfrågan från regeringskansliet och utgick ifrån att allt var i sin ordning. Nu får jag avvakta departementets egen utredning, sade han då.